Es gibt auch Anschlüsse für Wechsel auf andere Radfernwege, so z.B. Weser/Hessischer Radfernweg R1/Weser-Harz-Heide-Radweg: Der Endpunkt des Werratal-Radwegs ist zugleich Beginn des Weser-Radweges in Richtung Bremen (rechte Weserseite) und zum Hessischen Radfernweg R1 in Richtung Bad Karlshafen (linke Weserseite), wie auch zum Weser-Harz-Heide-Radweg nach Lüneburg.
Den Fulda-Radweg erreichen Sie von der Werra über den Hessischen Radfernweg "R5" ab Eschwege nach Rotenburg a. d. Fulda. Am Ende des Werratal-Radwegs erreichen Sie auch das Ende des Fulda-Radwegs (R1) und können diesen flussaufwärts fahren.
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